Time Machine Criptografado em HD com duas partições
Estive usando o Time Machine por meses até o Lion ser lançado, que com o FileVault 2 nos permitiu ter backups com o Time Machine criptografado.
Até então não é nenhum segredo você ter seu HD externo com o Time Machine criptografado. O problema vem a tona quando você tem um HD um pouco maior e quer que ele tenha duas partições, uma para o time machine criptografado e outra para você guardar dados livres, fora do alcance do Time Machine.

Time Machine Criptografado
A resposta é 42. To brincando …
A dica é que a segunda partição seja reservada para o Time Machine, use a primeira para o que quiser, mas mantenha a segunda para o Time Machine Criptografado.
Isso não parece nada com o estilo Apple de ser, mas infelizmente é assim que funciona.
Steve Jobs pensou nisso pra você.